明治6年清絃寺を借り受け有岡校として開設され、明治9年に木造校舎が建設されました。その後、何度か建て替えをおこないながら、昭和25年に綾部市の市政施行に伴い綾部市立吉美小学校と改称されました。平成8年には全面改築され、新しくなり現在に至ります。
令和4年度の児童数は、1学年13名、2学年29名、3学年16名、4学年29名、5学年27名、6学年38名(6学年のみ2学級)、全校児童152名です。教職員は、24名になり、児童数と合わせると176名になります。吉美小学校は、とても地域とのつながりが強い学校です。子どもたちは、地域の方々とふれあいながら様々な事を学んでいます。